wetbench_45 - Organismes synthétiques: un nouveau début

 

fr
Ça y est, c'est parti! Le premier organisme entièrement synthétique (fabriqué de toutes pièces) vient d'être créé par des scientifiques du J. Craig Venter Institute (1). La course aux applications commerciales est désormais lancée (2), mais certains émettent déjà des réserves (3).

en
C: Using synthetic organisms (1), we could create new antibiotics, produce biofuels, stop world hunger,... Hey! I could synthesize an organism that would make beer!
A: An organism that can produce beer? You mean like Saccharomyces cerevisiae?
C: ** thinking ** ... ** meditating ** ... ** inellecting ** ...
C: Aaargh! I've been scooped!!!

References
(1) First self-replicating synthetic bacterial cell
(2) Synthetic-biology competition launches
(3) Synthia is Alive … and Breeding: Panacea or Pandora's Box?
(3) Synthia est bien vivante et elle est parmi nous : panacée ou boîte de Pandore ?

wetbench_news: The neanderthal in us

fr
L'équipe du Dr Svante Pääbo à l'Institut Max Planck en Allemagne a récemment montré que des gènes des hommes de Néanderthal survivent en nous (1, 2, 3). Hein?!? Comment est-ce que c'est que ça as-tu bin pu arriver? Puisque nous sommes sur le sujet de Neanderthaliens: Si vous êtes l'un des maudits chanceux qui recevrez le nouveau jouet d'Apple demain aujourd'hui, vous pourrez voir de quoi vous auriez l'air en homme primitif.

en
A team led by Dr Svante Pääbo from the Max Planck Institute in Germany has recently shown that genes from Neanderthals have survived in us modern humans (3, 4, 5). Now how did that happen? Speaking of Neanderthals: if you are one of the lucky ones who owns Apple's new toy, you can check-out how you would look like as a primitive human.

Citations
(1) L'ADN de Néandertal révèle ses liens avec Sapiens
(2) Nous avons tous quelque chose de Néanderthal
(3) The Neandertal genome
(4) Neandertal Genome Study Reveals That We Have a Little Caveman in Us
(5) Neanderthal genes 'survive in us'

wetbench_44 - Étudiante graduée

fr
Il y a quelques semaines, j'ai entendu quelqu'un parler d'étudiant gradué sur une émission québécoise en balado-diffusion - La semaine verte, si ma mémoire est bonne. Ça faisait longtemps que je n'avais pas entendu cette expression. Surtout, ça m'a rappelé le temps lorsque moi-même j'étais étudiant gradué. Un collègue m'avait alors proposé d'illustrer une série d'anglicismes, dont l'idée pour ce billet de blog. Merci Denis Lauzer pour l'inspiration.

en
This one is not easy to translate, since it deals with a French anglicism. In English, a graduate student is a person who has earned a scholarly degree, e.g. a Bachelor's or a Master's. In Quebec (and also in Belgium, I've just learned), "Graduate Student" has been simply borrowed and turned into "étudiant gradué", which literally means a student with gradation marks (or measurements). I guess that the appropriate term would be "étudiant diplômé" or "étudiant de cycle supérieur, i.e a student who has earned a diploma or a student graduate studies, respectively. In France, they use the terms "Mastère" (pronounce: Ma-stair-uh, rolling the 'R' with a guttural sound) for a Master's candidate or "thèsard/thèsarde" (Tay-zar/Tay-zard-uh, masculin/feminin) for PhD candidates. IMHO, those don't sound much better.

wetbench_news: Waist to Hip Ratio

fr
La manière scientifique de dire que les hommes aiment regarder les filles avec un beau body...

Optimal Waist-to-Hip Ratios in Women Activate Neural Reward Centers in Men
Platek SM, Singh D (2010)
PLoS ONE 5(2): e9042. doi:10.1371/journal.pone.0009042

en
The scientific way to say that men like to check-out babes with big boobs.

wetbench_43 - Idénergie renouvelable III

fr
Quelles sont vos résolutions pour 2010?
En tout cas, bonne année, bonne chance et bonne santé!

en
What are your new year's resolutions?
In any case, best wishes for 2010!

wetbench_42 - Idénergie renouvelable II

fr
Croyez-vous que les salles de gym pourraient s'auto-suffire en récupérant l'énergie générée par toutes leurs machines?

Dommage que le sommet de Copenhague se soit terminé en échec. Par contre, cela ne nous empêche pas de faire un geste personnel pour l'environnement, même si le voisin ne veut pas faire d'effort. Quoi qu'il en soit, passez de joyeuses fêtes!

en
A: What's all this?
C: I plugged my Television to a generator powered by this stationary bicycle. Now, when I want to watch TV, I have to pedal. No more couch potato-ing! This way, I'm saving on electricity, helping out the environment and I'll get some exercise after all the holiday meals!
 
Do you think that gyms could be energetically self-sufficient from all the electricity that could be generated from their exercising machines?

Too bad that our leaders could not come to a sensible agreement in Copenhagen earlier this month. But that does not mean that we can't do a personal effort for the environment, even if the neighbour doesn't.

In any case, season's greetings! Go easy on the turkey!

wetbench_news: Science & Prostitution

(1) Scientist announces that she is call girl and blogger Belle de Jour.

fr
La recherche, c'est la misère! Aidez un chercheur: Faites un don (pizzas et bières acceptées).

Pour en savoir plus sur Dr Brooke Magnanti (alias Belle de Jour), une spécialiste en neurotoxicologie et d'épidémiologie du cancer qui a dû se tourner brièvement vers la prostitution pour un support financier durant ses études de thèse, vous pouvez consulter Wikipedia, ou visiter le blog de Belle de Jour.

Si quelqu'un veut faire un film sur ma vie, vous n'avez qu'à me contacter. Contrairement au Dr. Magnanti, je n'ai rien à vous raconter mais on pourrait peut-être faire comme ces films français où il ne se passe rien pendant deux heures mais que les critiques aiment quand même.

Let's be frank, postdocs are not well paid

Belle de Jour: On science and prostitution, New Scientist

en
Life in research is tough. Help save a scientist: Send food (will accept beer).

To find out more about Dr. Brooke Magnanti (a.k.a Belle de Jour), a specialist on neurotoxicology and cancer epidemiology who turned to prostitution for financial support during her Ph.D. studies, you can visit Wikipedia or Belle de Jour's blog.

If anyone wants to make a film about my blog or my life, please contact me. Unlike Dr. Magnanti's story, mine is not interesting but perhaps we can make one of those artsy French movies where nothing happens during two hours but appreciated by critics.

wetbench_41 - Idénergie renouvelable

fr
Je cherchais à illustrer une idée brillante... et, par les temps qui courent, mieux vaut la faire à basse consommation.

en
I was looking to illustrate a bright idea... and nowadays, I should also make it energy-saving.

wetbench_40 - Troll d'Hallowe'en

fr

Savez-vous comment on dit 'Trick or treat' en français? Bêtise ou friandises? Sucreries ou mauvais tour? Petites gâteries ou emmerderies (néologisme)? Je ne devrais pas trop me casser la tête car, de toute façon, l'Hallowe'en n'est pas trop célébré là où j'habite. Pour ceux qui vont faire la fête ou passer de porte à porte, attention aux abus de bonbons!

en

J: Trick or treat!

A: This is blackmail!
J: You betcha!
--

Hallowe'en isn't much celebrated where I now live, but for those of you who will be celebrating the event this week-end, enjoy (and watch out not to go overboard)!

wetbench_39 - Organismes synthétiques et transposons

fr
(*) Des scientifiques du J. Craig Venter Institute développent de nouvelles techniques qui permettraient de créer un génome bactérien de toute pièce. Ces micro-organismes seraient ainsi complètement synthétiques.

Par ailleurs, une découverte parue cette semaine dans la revue Nature nous révèle que 74% du matériel génétique du mildiou de la patate, maladie à l'origine de la famine et de l'exode irlandaise au 19e siècle, est composé d'éléments transposables. En gros, près de 3/4 du génome de ce pathogène est composé de 'cochonneries' génétiques répétitives, énergétiquement très coûteux à maintenir. Pire, ces séquences sont instables et sont donc sources de mutations! Alors pourquoi les conserver? Les transposons peuvent certes être la cause d'effets délétères mais, chez le mildiou, il semblerait que les changements qu'ils génèrent contribuent à déjouer les défenses de l'hôte. Sans ces transposons, il n'y aurait peut-être pas de défilés annuels de la Saint-Patrick à New York ou sur la rue Sainte-Catherine à Montréal!

Mais pour revenir aux bibittes artificielles des chercheurs du JCVI, s'ils construisaient deux populations de bactéries complètement identiques à l'exception que l'une contiendrait des transposons et que l'autre en serait dépourvue, laquelle se porterait mieux, à terme et dans un environnement changeant?

en

(*) New methods allow for the rapid engineering of bacterial chromosomes and the creation of extensively modified bacterial species; should also play key role in boot up of synthetic cell.

J: Yay! We've just been synthesized! ...So why the sad face?
K: Dude, they've made me with transposons!

In the news recently, scientists at the J. Craig Venter Institute find methods that should allow for the synthesis of living organisms, from scratch.

Another story published this week in Nature reveals that the genome of potato blight - the disease held responsible for the Irish famine and subsequent exodus in the 19th century - is mostly (3/4) made up of transposons. These are repeated genetic 'crap' that are energetically costly to maintain and that are highly unstable. Thus, they can be the cause of deleterious genetic mutations. So why keep these elements? Well, mutations are changes, and in the case of potato blight, change seems to be important for the pathogen to outsmart host defenses. Imagine: without transposons, there may not be St-Patrick's day parades in New York or on Montreal's Sainte-Catherine street!

So, getting back to the synthetic bugs of the JCVI researchers, if they were to synthesize two populations of organisms, one with and the other without transposons, which one would fare better in the long-run and in a changing environment?