wetbench_39 - Organismes synthétiques et transposons

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(*) Des scientifiques du J. Craig Venter Institute développent de nouvelles techniques qui permettraient de créer un génome bactérien de toute pièce. Ces micro-organismes seraient ainsi complètement synthétiques.

Par ailleurs, une découverte parue cette semaine dans la revue Nature nous révèle que 74% du matériel génétique du mildiou de la patate, maladie à l'origine de la famine et de l'exode irlandaise au 19e siècle, est composé d'éléments transposables. En gros, près de 3/4 du génome de ce pathogène est composé de 'cochonneries' génétiques répétitives, énergétiquement très coûteux à maintenir. Pire, ces séquences sont instables et sont donc sources de mutations! Alors pourquoi les conserver? Les transposons peuvent certes être la cause d'effets délétères mais, chez le mildiou, il semblerait que les changements qu'ils génèrent contribuent à déjouer les défenses de l'hôte. Sans ces transposons, il n'y aurait peut-être pas de défilés annuels de la Saint-Patrick à New York ou sur la rue Sainte-Catherine à Montréal!

Mais pour revenir aux bibittes artificielles des chercheurs du JCVI, s'ils construisaient deux populations de bactéries complètement identiques à l'exception que l'une contiendrait des transposons et que l'autre en serait dépourvue, laquelle se porterait mieux, à terme et dans un environnement changeant?

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(*) New methods allow for the rapid engineering of bacterial chromosomes and the creation of extensively modified bacterial species; should also play key role in boot up of synthetic cell.

J: Yay! We've just been synthesized! ...So why the sad face?
K: Dude, they've made me with transposons!

In the news recently, scientists at the J. Craig Venter Institute find methods that should allow for the synthesis of living organisms, from scratch.

Another story published this week in Nature reveals that the genome of potato blight - the disease held responsible for the Irish famine and subsequent exodus in the 19th century - is mostly (3/4) made up of transposons. These are repeated genetic 'crap' that are energetically costly to maintain and that are highly unstable. Thus, they can be the cause of deleterious genetic mutations. So why keep these elements? Well, mutations are changes, and in the case of potato blight, change seems to be important for the pathogen to outsmart host defenses. Imagine: without transposons, there may not be St-Patrick's day parades in New York or on Montreal's Sainte-Catherine street!

So, getting back to the synthetic bugs of the JCVI researchers, if they were to synthesize two populations of organisms, one with and the other without transposons, which one would fare better in the long-run and in a changing environment?